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你觉得自己很辛苦?深圳大学第一附属医院 973 团队 Nature Methods 41 个 Figure 讲述高度可控 cas9 的智能工具

Submit on 2016Year09Month06Day

小编时常在思索,在 Zhang Feng 大神一篇又一篇 CNS ,发的速度比我们读的速度还快的时候,当 Timothy K. Lu、David Baker 和 GM church 大师们,连续两周连续两篇 Science paper 的时...

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王晓东实验室发现细胞色素 C 释放的新机理

Submit on 2016Year08Month11Day

2016年7月21日,nibs 王晓东实验室和张志远实验室合作在 《Molecular cell》 杂志发表题为 “A Small Molecule That Protects the Integrity of the Electron T...

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合成生物学:细菌递送药物

Submit on 2016Year08Month10Day

将细胞重编程为血液细胞的效力被认为依赖于原始细胞的类型及重编程的方法,近日刊登于国际杂志 Cell Stem Cell 上的一项研究报告中,来自日本京都大学 iPS 细胞研究所 (CiRA) 的研究人员通过研究表示,这种假设实际上是表观遗传...

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Cell Stem Cell:原始细胞类型或并不会影响诱导多能干细胞分化为血液细胞

Submit on 2016Year08Month08Day

将细胞重编程为血液细胞的效力被认为依赖于原始细胞的类型及重编程的方法,近日刊登于国际杂志 Cell Stem Cell 上的一项研究报告中,来自日本京都大学 iPS 细胞研究所 (CiRA) 的研究人员通过研究表示,这种假设实际上是表观...

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比blast生猛的同源序列搜索程序HMMER 3.0使用教程#每天进步一点点#

Submit on 2016Year08Month04Day

by Dacheng HMMER 被用于在序列数据库中搜索同源序列,产生同源序列比对,所使用的方法是基于隐马尔科夫模型。HMMER 常常与 profile 数据库连用,例如 Pfam 等。但是 HMMER 同时能够处理特定的索引,并不仅仅...

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手把手教你使用 rosetta 进行药物设计#每天进步一点点#

Submit on 2016Year08Month03Day

小伙伴们,大家好,又到了 #每天进步一点点# 的时候了,科学没有捷径,进步没有妥协,只有我们不断坚持,才能收获成长,才能在不断的碰壁过程中不断前进。 小编高考失利,前往西部的一所高校,自己常常想,自己与他人的差距究...

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中山大学课题组 Cell 解析获得性免疫起源#跟 CNS 学思维#

Submit on 2016Year08Month02Day

小伙伴们,大家好,今天我们来学习cell的一篇文章,既然我们的标题是#跟 CNS 学思维#,牛皮不是吹的,火车不是推的,既然是学习思维,无论我们在哪一个领域,无论我们是不是研究免疫,我们都可以从中学习有助于我们课题的思维方式。废话不多说了,首先...

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蛋白晶体结构里面那些有意思的分析#每天进步一点点#

Submit on 2016Year08Month01Day

by 大程跟大家分享自己昨天看到了三句话: 实验开始时,自己一人处理所有问题,老板整天忙着临床手术,没有时间理会我的实验。 每次见他,我说“实验很难,摸不到头绪。” 老板回答“不主动,不动手,不碰壁,是不能有技术的,包括实验和手术。” 整个实...

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如何绘制漂亮的多序列比对图片?#每天进步一点点#

Submit on 2016Year07Month27Day

先给大家讲个小故事,有一种只生长在中国最东边的竹子—毛竹,精心培育,悉心照料,4年不过长3厘米,十分缓慢……但是!第五年开始,每天就要生长足足 30 厘米!6 周就可以长到 15 米!4年 3 厘米,6 周 15 米…看似不可思议,只是因为 ...

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合成生物学青年论坛 第一日

Submit on 2016Year07Month15Day

大家好,今天我们迎来的合成生物学领域的知识盛宴,让小编带领大家以来回顾今天科学家们精彩纷呈的报告吧~特邀报告 王磊来自UCSF的王磊教授主要研究的重点是非天然氨基酸。在2014年wang Lei课题组通过在蛋白中引入非天然氨基酸,从而实现蛋白质...

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喜贺合生基因再获五项关键软著

Submit on 2016Year05Month30Day

从2015年10月至2016年3月底,北京合生基因科技有限公司陆续开发完成并发表了《合生账号系统》、《合生基因博客分享系统》、《基因元件共享平台》、《客户咨询系统》及《生物科研试剂交易平台》五项软件系统;近日,中华人民共和国国家版权局对北京合生...

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谷歌有AlphaGo,合生有NgAgo!

Submit on 2016Year05Month25Day

超越 CRISPR/Cas9 的基因编辑技术来了,NgAgo = National Gene-editing Approach Generates Opportunities !NgAgo 的全名为 Natronobacterium grego...

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施一公学生的博士毕业论文长啥样?

Submit on 2016Year05Month19Day

大程大家好,俗话说的好,榜样的力量是无穷的,今天小编近水楼台先得月,跟大家一起拜读参与施一公教授多项重大成果的闫创业博士的博士论文。清华大学生命学院博士闫创业,是保定一中 2005 届理科实验班毕业生。闫创业同学在 2004 年的全国生物奥赛中...

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个人基因组测序降到 500 元以内后基因组学将有哪些大的改变?

Submit on 2016Year05Month17Day

来源:知乎那对单细胞组学的发展将是多么广阔的前景。群体测序的异质性已经太阻碍我们认识很多情况的本质了,以至于对于细微的差异根本察觉不到,而这些差距又是非常之关键的。就比如说对于干细胞、肿瘤以及衰老这些现在热门的生物学问题,都已经有人做过单细胞水...

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NgAgo最全Protocol火热出炉!

Submit on 2016Year05Month16Day

大程大家好,我们继续上周的话题,今天将关注 NgAgo 的实验细节:一、靶序列的设计首先我们选择我们感兴趣的基因,这里以 TP53 为例,我们通过 CCDS 数据库,获取 TP53 不同转录本的公共区域。我们得到关于TP53如下的结果:我们点击...

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关于 NgAgo未来的课题

Submit on 2016Year05Month13Day

关于 NgAgo 未来的课题,各种大牛们怎么看?未来会出来那些大 paper ?小伙伴们,大家好,今天我们继续昨日的话题,昨天我们讲到了韩春雨老师的参考文献中的内容,涉及了 NgAgo 最初发现时候的相关背景。在 NgAgo 被大家认为极有可能...

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NAR:如何快速设计多条 qPCR 引物?

Submit on 2016Year05Month12Day

By 大程 小伙伴们,大家新的一周已经开始啦,有没有从周末中复苏过来,今天首先让我们来了解一款快速设计多条 qPCR 引物的数据库。MRPrimer 使用篇qPCR 成为诊断检测等多种技术手段的有利工具,在一个实验中,往往我们要设计多条 qP...

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NgAgo 深入解读—生物原理篇

Submit on 2016Year05Month11Day

小伙伴们,大家好,韩春雨老师的 NgAgo 蛋白的发现,可谓一鸣惊人,瞬间火爆了大江南北,在我们感慨韩老师的惊人毅力与卓越的持之以恒精神的时候,不妨来重读14年给予韩老师伟大灵感的文献。 14年3月来自西班牙的科学家们,在细菌中发现一种可以以...

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小分子诱导型cas9华丽诞生!

Submit on 2016Year05Month10Day

小伙伴们,大家五四青年节快乐!在最新一期的 Nature Biotech 文章上,来自加利福尼亚大学伯克利分校的 David Savage 等人,成功实现了将 cas9 变成诱导型酶,从而实现 cas9 可逆诱导激活和切割。 在蛋白进化的历史...

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如何从基因集中找到最想要的信息?基因集分析

Submit on 2016Year04Month27Day

如果我们筛选得到一系列基因,我们如何富集其中相应的功能?什么因素影响基因集合的分析?全基因组关联分析对于鉴定与表型相关的一系列基因起到了关键的作用。最常使用的工具是 “Gene-set analysis” (基因集分析),也被称为 pathwa...

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让 cas9 像彩虹一样标记多个基因组位点

Submit on 2016Year04Month22Day

小伙伴们,大家好,今天我们来一同学习 Nature biotechnology 最新的一篇文章,使用 cas9 成像技术复杂标记多个基因组位点。本篇文章的通讯作者是麻省大学的 Thoru pederson,他一直关注 RNA 追踪等成像问题,目...

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Nature:如何设计新药?Autodock 分子对接指南(一)

Submit on 2016Year04Month22Day

如何设计新药?Autodock 分子对接指南(一)计算对接可以被用来预测结合构象和小分子结合到大分子的自由能。分子对接在研究大分子之间相互作用机制和结构辅助的药物设计上发挥重要的作用。这个方法可以很快速的筛选包含成千上万个化合物的药物文库。...

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Nature:癌症的真相,你到底被忽悠了多久?

Submit on 2016Year04Month19Day

是否真的需要最大化化疗剂量?耐药是否真的是一段时间之后才有?大家好~~又是新的一周,这周我们一同关注最新一期 Nature 上的评论“ Tumours are subject to the same rules of natural selec...

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真的要锻炼身体了!!抗生素耐药机制远远超乎人们想象

Submit on 2016Year04Month13Day

抗生素耐药正日益成为困扰人们健康的杀手,然而关于抗生素耐药的相关机制仍然不是非常清楚,来自法国的科学家在最新一期的 science 发文使用新型测序手段,发现许多抗生素调节 riboswitch 和 attenuator 元件存在于细菌基因组中...

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确认了!熬夜真的可以导致白血病!!!!跟 cell 一起学思维

Submit on 2016Year04Month12Day

熬夜真的可以导致白血病吗?为什么白血病跟熬夜相关?大家好,今天小雨的北京带来一丝寒意,让我们一起来阅读最新一期 cell 上的第二篇文献,Core Circadian Clock Genes Regulate Leukemia Stem Cel...

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环状 RNA 导致白血病!!#跟 CNS 学思维#

Submit on 2016Year04Month11Day

大家好,又到了新的一周,今天我们主要来学习最新一期 Cell 的文章 Oncogenic Role of Fusion-circRNAs Derived from Cancer-Associated Chromosomal Transloc...

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肿瘤免疫 PD-1 疗法究竟如何起作用?从组学水平回答免疫治疗新机制

Submit on 2016Year04Month06Day

PD-1 肿瘤免疫监测点阻断疗法对于黑色素瘤患者提供了良好的福音,但是随着研究的进一步的推进,人们发现有些患者对于肿瘤免疫疗法有着很好的反应预期,但是有一些患者却没有预期的应答,那么肿瘤患者体内的突变对于免疫疗效有着怎样的干扰?PD-1 免疫治...

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聊聊“乙醇沉淀”那点事儿

Submit on 2016Year04Month05Day

小伙伴们,大家好,小长假过去了,大家玩的可还开心? 上次我们一起聊了关于 real-time PCR 和提取 RNA 的步骤和方法,今天我们一起来聊聊乙醇沉淀那些事儿。一起看看乙醇沉淀要比质粒小提早上 50 年,当我们想要特定的去除溶液中...

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手把手教你做 real-time PCR(二)

Submit on 2016Year03Month31Day

大家好,前天我们一起学习了 real time PCR 后,大家有没有掌握了 real time PCR 的基本概念那?首先让我们来一起复习一下~~So 问题来了,什么是 Ct 值?今天我们主要来学习学习 real time PCR 实...

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如何研究 lncRNA?#合生学院 第二讲#

Submit on 2016Year03Month29Day

大家好,今天我们一同走进 lncRNA 的领域,lncRNA 越来越引起人们的重视,在肿瘤的发生发展过程中,也被认为扮演重要的角色,那么如何使用 lncRNA 的表达数据进行大数据挖掘,发现背后潜在的规律?当我们遇到感兴趣的 lncRN...

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手把手教你做 real-time PCR(一)

Submit on 2016Year03Month29Day

大家好,阳光明媚,今天我们来走进一个新的系列,最全基本实验学习系列,今天,我们主要来学习 real-time PCR 的基础知识和操作方法。一、 real-time PCR 的基本原理师兄,师兄,我从来没有做过定量 PCR,到底怎么做啊...

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咱们一起画彩虹!#“极客与 EvaGreen ”有奖试用活动#

Submit on 2016Year03Month28Day

各位小伙伴们,您的好友“ 生物极客(BioGeek ) ”已经上线!时隔一周,大家是不是有些想念呢?为了回报各位小伙伴对合生基因的大力支持,本次的活动奖励可谓是“重量级”~不过这次在看到奖品之前,大家要先拥抱一下本次活动的主角——荧光...

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快讯:“小诺贝尔奖”出炉,CRISPR 大牛张锋与 Doudna 共同获奖

Submit on 2016Year03Month25Day

加拿大盖尔德内尔基金会网站近日公布了 2016 年加拿大盖尔德内尔奖(Canada Gairdner Awards)的获得者名单,共有来自美国、德国、法国和加拿大的 7 名科学家摘取了该奖的三个子奖项。每位获奖者在获得 10 万加元奖金的同时,...

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“自私”与“无私”,这是一个问题

Submit on 2016Year03Month24Day

加州大学洛杉矶分校(UCLA)的研究员 Leonardo 和同事进行了一项关于识别与’善解人意’思维相关脑区的研究。该研究吸收了 20 名参与者,研究者为每个参与者安排了’任务’,并在参与者进行’任务’时使用功能磁共振成像(fMRI)进行脑部扫...

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如何将大数据挖掘与 lncRNA 结合起来增益你的研究?

Submit on 2016Year03Month23Day

大家好,今天我们一同走进 lncRNA 的领域,lncRNA 越来越引起人们的重视,在肿瘤的发生发展过程中,也被认为扮演重要的角色,那么如何使用 lncRNA 的表达数据进行大数据挖掘,发现背后潜在的规律?今天我们一同走进华人科学家 z...

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T 细胞疗法治疗实体瘤获得巨大突破

Submit on 2016Year03Month22Day

问题 为什么 T 细胞免疫疗法治疗实体瘤效果不好? 科学家们如何克服这一障碍实现有效治疗?大家好,昨天我们一同学习了使用抗体增强 PD-L1 的疗效,在免疫治疗领域,除了抗体疗法外,最大的明星莫过于 T 细胞疗法,T 细胞疗法主要包括 Ca...

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重大突破! 新型抗体逆转肿瘤微环境实现PD-L1免疫阻断

Submit on 2016Year03Month21Day

小伙伴们大家好,阳春三月,繁花似锦,大家有没有觉得需要加深一下对文献的阅读呀,今天让我们来一起阅读最新一期 Cancer cell 上的中国科学家的工作,逆转肿瘤微环境,帮助 PD-L1 免疫阻断。 程序性细胞死亡受体,(PD-1)和配体 P...

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如何使用 pubmed 加速你的研究?By 大程

Submit on 2016Year03Month18Day

大家好,今天生物极客公众号推出合生学院视频教程系列,手把手演示~~今天让我们来关注如何使用 pubmed,更好的寻找文献,小伙伴们,有没有对期待想对文献进行精炼,只寻找特定杂志,特定影响因子的文章呀?小伙伴们,感不感兴趣如何在 pubmed 按...

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喜贺合生基因获得“生物材料信息管理系统”软著

Submit on 2016Year03Month18Day

近日,中华人民共和国国家版权局对北京合生基因科技有限公司提交的“生物材料信息管理系统”软件著作权认定为原始取得并予以登记,从颁证之日起,这项信息管理系统软件的版权将得到中国版权保护中心的有效保护。合生基因技术部、市场部及信息部团队对国内当前的生...

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Nature:怎样找回初恋的美好记忆?

Submit on 2016Year03Month18Day

#神经生物学最新进展#早期阿尔茨海默症(Alzheimer’s Disease, AD)患者会遗忘最近所经历的事情,然而 MIT 的研究者通过刊登在《Nature》上的一篇研究论文表示,这些’被遗忘的记忆’仍然储存在大脑中,而 AD 患者面临的...

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史上最全单细胞测序教程(三)

Submit on 2016Year03Month17Day

#史上最全单细胞测序第三讲-数据处理篇# By 大程大家好,学完前两讲后,有没有对于单细胞测序有一个初步的认识那?so~~问题来了,什么是 STRT? 想不起来了不要紧,关注 生物极客 公众号,查看历史消息,可以了解单细胞测序的相关内容,...

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史上最全单细胞测序教程(二)

Submit on 2016Year03Month16Day

#史上最全单细胞测序第二讲# By 大程小伙伴们,大家好,今天让我们来继续聊聊单细胞测序的那些事儿,上一讲我们讲到了不同单细胞 DNA 测序的方法,比较了不同测序方法的异同?大家还记得吗?这里给一张图片供大家复习参考: 今天,我们主要来了解一...

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CRISPR/Cas9专利纷争白热化,MIT与UC Berkeley针锋相对

Submit on 2016Year03Month15Day

提到 CRISPR/Cas9 基因编辑技术,我们不仅会想到神奇的基因“剪刀”,还会想到今后谁会是卖“剪刀”的人。近期,美国麻省理工(MIT)的华裔科学家张锋,美国加州大学伯克利分校(UC Berkeley)的科学家 Jennifer D...

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病毒中也存在CRISPR系统?

Submit on 2016Year03Month14Day

#大程带你读CNS#自从巨型病毒被发现后,巨型病毒所展现的一些特征挑战着目前人们对于病毒定义的一些基本认识,比如,他们复杂和巨大的基因组。可以被噬病毒体感染,同时在基因组内包含可以传播的线性噬病毒体基因元件等。来自法国的科学家们,系统的探究了噬...

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史上最全单细胞测序教程(一)

Submit on 2016Year03Month09Day

#大程教你如何做单细胞测序#小伙伴们,大家好,今天我们来开启一个新的话题,Single cell sequence,近来单细胞测序在探索生物过程、疾病机理等方面展现了前所未有的精度,通过对单细胞进行 DNA 和 RNAseq 我们得以高精度的了...

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《中国青年》杂志报道合生基因CEO创业之路

Submit on 2016Year02Month24Day

2016年2月3日,《中国青年》杂志发表了一篇标题为“蒋云:不怕你不干,就怕你不想”的文章,主要讲述了北京合生基因科技有限公司首席执行官-蒋云的创业之路。蒋云在大学时期,兴趣广泛,掌握了许多的生物学知识,奠定了创业的基础;经历了毕业之际的一波三...

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合生基因与博澳瑞斯结成战略合作伙伴

Submit on 2016Year01Month29Day

2016年1月,国内领先的合成生物学医药技术企业——北京合生基因科技有限公司与北京博澳瑞斯生物科技有限公司的战略合作签约仪式在合生基因北京总部举行。合作双方约定在生命科学产业链的多个方面展开全方位的深度合作,结成技术互补、互利共赢的战略合作伙伴...

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合生基因参展中关村生命科学园15周年庆

Submit on 2015Year10Month19Day

9月18日,2015年中关村生命科学园发展论坛在京成功召开。本次会议以“创新赢未来”为主题,会议主要内容为介绍和总结中关村生命科学园区内科研机构及企业在2014年的阶段发展概况,并且对园区的未来发展进行了展望。北京合生基因科技有限公司受邀参展此...

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Nature:肿瘤抑制蛋白竟驱动恶性癌症

Submit on 2015Year09Month16Day

近日,来自宾夕法尼亚大学等处的科学家们研究发现,恶性肿瘤的生长及DNA序列未发生改变的基因活性的变化和突变的p53蛋白质直接相关,相关研究结果刊登于国际著名杂志《Nature》上。TP53是所有人类癌症中频繁突变的基因,它可以编码一种名为p53...

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新型Cas9晶体结构得到解析

Submit on 2015Year09Month04Day

8月27日,美国麻省理工学院(MIT)张锋博士课题组在《Cell》杂志上发表了一篇名为《Crystal Structure of Staphylococcus aureus Cas9》的学术论文,论文内容是金黄色葡萄球菌Cas9(SaCas9)...

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CRISPR-Cas9:通往美丽新世界的钥匙还是潘朵拉魔盒?

Submit on 2015Year08Month20Day

2015年7月22日,美国著名科技类杂志《连线》刊载了一篇由Amy Maxmen撰写的题为《Easy DNA Editing Will Remake the World. Buckle Up.》的文章。作者在文中对基因编辑技术的演化历程进行了总...

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像开关灯一样控制基因编辑?光活化的CRISPR-Cas9系统

Submit on 2015Year08Month05Day

自2012年CRISPR-Cas9技术在学术界崭露头角,便凭借基因改造能力和基因治疗潜力,扮演着基因编辑领域受关注度最高的“宠儿”角色。然而,CRISPR-Cas9系统中以不可控的Cas9核酸酶活性为主要诱因之一的脱靶效应,也始终是一片笼罩研究...

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生物信息学与智能信息处理2015学术年会

Submit on 2015Year07Month01Day

由中国人工智能学会主办,中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会和厦门大学承办的生物信息学与智能信息处理2015学术年会,于2015年6月17日至19日在厦门成功举行。北京市合生基因科技有限公司如邀参加展会,展示了为生物行业量身打造信息化...

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2015第二届基因编辑研讨会在上海拉开帷幕

Submit on 2015Year07Month01Day

由上海生物谷主办,合生基因赞助,梅斯医学和相关媒体支持的《2015(第二届)基因编辑研讨会》于2015年6月25日在上海好望角大饭店隆重开幕。北京合生基因科技有限公司作为赞助商如邀参加展会。 出席本次会议的嘉宾有来自中国科学院上海生命科学研究...

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第二届全国计算生物学与生物信息学学术会议在京召开

Submit on 2015Year06Month09Day

2015年4月15-17日第二届全国计算生物学与生物信息学学术会议在北京西郊宾馆成功召开。高通量测序技术的快速应用,产生了各种海量组学数据,这不仅对生物学研究人员提出了新挑战,也对计算分析的软硬件提出了新的挑战。计算生物学与生物信息学是应对这种...

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首届合成生物学青年学者论坛在京拉开帷幕

Submit on 2015Year06Month02Day

2015年5月23日首届 合成生物学青年学者论坛(Synthetic Biology Young Scholar Forum, SynBioYSF) 在北京清华大学举行。本次会议旨在加强从事合成生物学研究青年学者之间的联系,交流设计、制...

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第三届数学、计算机与生命科学交叉研究青年学者论坛在京举行

Submit on 2015Year06Month02Day

2015年5月16-17日 第三届数学、计算机与生命科学交叉研究青年学者论坛 在北京中国科学院数学与系统科学研究院举办。数学、计算机与生命科学交叉研究青年学者论坛旨在加强从事 “数学、计算机与生命科学交叉研究”青年学者之间的联系,交流生...

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第八届世界癌症大会——合生基因精彩亮相

Submit on 2015Year05Month20Day

2015年5月17日, 第八届世界癌症大会 (WCC 2015)在北京国际会议中心圆满落下帷幕。本届展会吸引了有来自美国、英国、法国、日本、印度、新加坡、俄罗斯等30多个国家和地区的企业参与。合生基因作为本次大会的唯一赞助商取得了圆满成...

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合生基因-合成生物学专家/未来生物技术服务提供者

Submit on 2015Year05Month06Day

2014年8月,国内第一家专注于合成生物学在科研和医药健康领域应用的生物技术公司——北京合生基因科技有限公司(Beijing Syngentech Co., LTD.)于北京中关村生命科学园成立。合生基因致力于为全球生命科学研究者提供世界一流的...

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